Selain memiliki beberapa program unggulan, Yayasan Rumah Tahfidz Alfatihah memiliki program-program internal untuk meningkatkan kualitas calon pendidik di Yayasan Rumah Tahfidz Alfatihah. Untuk mewujudkan komitmen sekaligus pengembangan di bidang pendidikan, Yayasan Rumah Tahfidz Alfatihah menginisiasi program bertajuk Alfatihah Leadership. Kegiatan ini ditujukan pada mereka yang ingin bertumbuh serta bermanfaat bagi umat melalui bidang pendidikan Al-Quran. Program yang berbasis di Kota Semarang ini rencananya akan dibuka bagi 10 orang pada tiap angkatan program.

Program Alfatihah Leadership sedianya akan diperuntukan sebagai wadah belajar dan latihan (training) bagi calon tenaga pendidik untuk para santri di berbagai cabang Rumah tahfidz Alfatihah.  Nantinya, program ini akan dibuka melalui tahapan seleksi microteaching terlebih dahulu untuk mengetahui kompetensi calon pendidik. Jika nantinya sudah lolos seleksi, para calon tenaga pendidik akan menjalani masa training untuk memahami kurikulum pendidikan khas Yayasan Rumah Tahfidz Alfatihah. Kurikulum pendidikan khas Yayasan Rumah Tahfidz Alfatihah menggunakan metode unik yaitu berupa metode menghafal Al-Quran dengan gerakan tangan.